Transcript of Q&A with Dr. Díaz-Gay
(La transcripción en español de la "Preguntas y respuestas con el Dr. Díaz-Gay" se encuentra a continuación).
Introducing Marcos Díaz-Gay (from Spain)
My name is Marcos Díaz-Gay, I work as a postdoctoral scholar in the Cellular and Molecular Medicine Department at the Alexandrov Lab at UCSD - University of California, San Diego.
Describe your research contributions...
In our lab we work on cancer genomics and mainly on mutational signatures. Mutational signatures is a recent developed methodology that allow us to identify the processes responsible for the mutations, so the genomic alterations that we see in the tumors, by actually looking at the patterns of these mutations. So, looking at the actual nucleotides before and after, for example, the actual mutation that we see. And in this regard, just taking a look at the final picture that the DNA sequencing provides, we are able to identify, to infer the causes and the origins of the tumors, with great implications in both cancer treatment and cancer prevention.
To elaborate on this, my work here for the first year was a little bit impacted, of course, by the pandemic. But I was able to lead the development and the release of a new catalogue - a new database - of the reference mutational signatures that are reference patterns of genomic alterations that are linked to specific processes.
So, for example, tobacco smoking and UV light...We know that there is a well-known established pattern for these mutations, but there are also many other different processes also including internal cell mechanisms or even certain drugs like antineoplastic treatments that cause specific patterns of mutation.
We work also with different international consortiums, in order to look for differences between tumors around the world with different exposures present in different countries, such as, for example, the case of the aristolochic acid that was used for traditional herbal remedies in different countries and the exposure to this specific acid leads to high risk of kidney cancer and that is particularly important for specific places around the world.
And finally, I will also work a lot on clonal evolution in the next upcoming times, and this is with the idea to look at the different stages of tumor evolution and try to know which are the processes involved in the different stages of the different moments of the evolution of the cancers.
How did your research bring you to UC San Diego?
I came to UCSD, UC San Diego, basically because one of the leaders in the field of the world is my current PI, Dr. Ludmil Alexandrov. I had the honor of joining the lab in 2019 as part of my PhD training, so I was doing my PhD in the IDIBAPS in Barcelona, Spain. And, so, in our research we studied hereditary colorectal cancer and we started working on this mutational signature methodology and I had the possibility to come here. We were able to use the methodology also for my PhD project. After being here I fell in love with the city (San Diego), with the weather, with everything. I just tried to come back, convinced my wife at home and we are here now.
What do you miss most about your home country (Spain)?
You always miss, mostly everything ... I mean the food, the culture, even the soccer games sometimes...but we watch it online right now.
Well, you know, this situation and everything that happened in 2020 for everybody I think what you miss the most is your family and of course to be together with your people and mostly my wife's and my family is in Spain. Also, my friends, and you always miss this contact.
People just get used to Zoom meetings and this kind of stuff at least we can see each other.
What do you enjoy about living in San Diego?
I love the friendly people I found here. As I told you I was here in 2019 for some time before coming as a postdoc. I really liked the city.
This year was a little more difficult of course but even like that you can just go outside, go to the beach, and living close to the beach is very nice.
Yeah, you get used to all of the U.S. things like your big cars, these fixed showers in the wall, and the traffic lights on the other side of the intersection - these kind of things... But, yeah, I really like to be here, and I hope we can stay - I can stay for some time as a postdoc here.
Tell us a fun fact about yourself....
I used to do a lot of sports, I actually did some CrossFit before coming to UCSD, but after everything that happened with the pandemic...Right now, I'm more working on the eSports - I actually was the runner-up in one of the UCSD tournaments - of one very famous soccer video games! So yeah, I change it.
Transcripción de preguntas y respuestas con el Dr. Díaz-Gay
Presentamos a Marcos Díaz-Gay (de España)
Mi nombre es Marcos Díaz-Gay, trabajo como investigador postdoctoral en el Departamento de Medicina Celular y Molecular en el Alexandrov Lab de UCSD - Universidad de California, San Diego.
Describe tu investigación ...
En nuestro laboratorio trabajamos en genómica del cáncer y principalmente en firmas mutacionales. Las firmas mutacionales se trata de una metodología desarrollada recientemente que nos permite identificar los procesos responsables de las mutaciones, es decir, las alteraciones genómicas que vemos en los tumores, al observar los patrones concretos de estas mutaciones. Por ejemplo, los nucleótidos antes y después de la mutación concreta que vemos. Y en este sentido, con solo echar un vistazo a la imagen final que proporciona la secuenciación del ADN, podemos identificar las causas y el origen de los tumores, lo que tiene grandes implicaciones tanto en el tratamiento como en la prevención del cáncer.
Mi trabajo aquí durante el primer año se vio afectado, por supuesto, por la pandemia. Pero pude liderar el desarrollo y el lanzamiento de un nuevo catálogo, una nueva base de datos, de las firmas mutacionales de referencia, que son patrones de referencia de alteraciones genómicas vinculadas a procesos concretos.
Entonces, por ejemplo, el tabaquismo y la luz ultravioleta ... Sabemos que existe un patrón conocido para estas mutaciones, pero también hay muchos otros procesos, entre los que se incluyen mecanismos celulares internos o incluso ciertos medicamentos, como tratamientos antineoplásicos, que causan un determinado patrón de mutaciones.
Trabajamos también con diferentes consorcios internacionales, con el fin de buscar diferencias entre distintos tipos de cáncer alrededor del mundo con distintas exposiciones en diferentes países, como, por ejemplo, el caso del ácido aristolóquico, que se encontraba en hierbas medicinales tradicionales en diferentes países y cuya exposición conduce a un alto riesgo de cáncer de riñón. Esto es particularmente importante para ciertos países.
Y finalmente, también trabajaré mucho en la evolución clonal del cáncer en los próximos tiempos, y esto es con la idea de identificar las distintas etapas de la evolución tumoral e intentar saber cuáles son los procesos involucrados en estas etapas de la evolución de los tumores.
¿Cómo te llevó tu investigación a UC San Diego?
Vine a UCSD, UC San Diego, básicamente porque uno de los líderes de nuestro campo de estudio es mi actual jefe, el Dr. Ludmil Alexandrov. Tuve el honor de unirme al laboratorio en 2019 como parte de mi formación de doctorado, cuando estaba realizando mi doctorado en el IDIBAPS en Barcelona, España. En nuestra investigación estudiábamos el cáncer colorrectal hereditario y comenzamos a trabajar en esta metodología de firmas mutacionales, y tuve la posibilidad de venir aquí con Ludmil ... Pudimos usar esta metodología para mi proyecto de doctorado. Después de estar aquí básicamente me enamoré de la ciudad (San Diego), del clima, de todo. Así que simplemente volví a casa, convencí a mi pareja para venirnos y aquí estamos ahora.
¿Qué es lo que más echas de menos de tu país de origen (España)?
Siempre echas de menos, básicamente todo ... La comida, la cultura, incluso los partidos de fútbol a veces ... pero vamos, que lo vemos online sin problemas.
Bueno, ya sabes, con esta situación y todo lo que ha pasado en 2020 para todos, creo que al final lo que más echas de menos es a tu familia y, por supuesto, estar con los tuyos. Tanto la familia de mi pareja como la mía están en España. También mis amigos, siempre se echa de menos ese contacto.
Afortunadamente, la gente se ha acostumbrado a las reuniones por Zoom y este tipo de cosas, así que al menos podemos vernos.
¿Qué te gusta de vivir en San Diego?
Me encanta la gente amable que me he encontrado aquí. Como ya he dicho, estuve aquí en 2019 durante unos meses antes de venir como postdoc. Me gustó mucho la ciudad. Este año ha sido un poco más difícil, por supuesto, pero aún así aquí puedes salir, ir a la playa, y vivir cerca de la playa está muy bien. Sí, y te acostumbras a todas las cosas de EE. UU., como vuestros coches enormes, estas duchas fijas en la pared, los semáforos al otro lado del cruce, ese tipo de cosas ... Pero sí, realmente me gusta estar aquí, y espero que podamos quedarnos. Que pueda quedarme durante un tiempo como postdoc aquí.
Cuéntanos un dato divertido sobre ti ...
Solía hacer muchos deportes, de hecho, hacía CrossFit antes de venir a la UCSD, pero la verdad es que con todo el tema de la pandemia... Ahora mismo estoy más metido en los eSports – de hecho, quedé subcampeón en uno de los torneos de la UCSD de un famoso videojuego de fútbol.
Enlaces del investigador para compartir:
Dato curioso - Referencia de eSports: